دانشکده علوم طبیعی در هر یک از شاخه‌های علوم مواد و انرژی، علوم جانداران و علوم مهندسی و تسخیر طبیعت فارغ التحصیلان را از روش‌های تجربه کرده و ساختن و طبقه‌بندی‌ها آگاه نمی‌نماید و بعد برای تحقیق در این رشته‌ها آماده می‌کند.این سه شاخه علوم طبیعی دروس مشترکی دارند که برای تربیت هر فارغ التحصیل این دانشکده ضروری است. برای مثال، هر فارغ التحصیل دانشکده علوم طبیعی باید کمی از هر یک از این سه شاخه را بداند و مبانی مشترک تحقیق در این شاخه‌ها را بشناسد و در آنها مهارت یابد. بعد در نیمه دوم تحصیلاتش به نظریات و روش‌های تحقیق در شاخه اختصاصی خودش بپردازد. روش‌های تحقیق در علوم مواد و انرژی و علوم مهندسی و تسخیر طبیعت و روش‌های تحقیق در علوم جانداران متفاوت به نظر می‌رسند. به عنوان مثال در تحقیق در علوم مواد و انرژی و علوم مهندسی و تسخیر طبیعت آزمایش‌ها معمولا تکرار‌پذیر هستند. در صورتی که در علوم جانداران عکس این به نظر می‌رسد. ممکن است روش‌های تکرار آزمایش‌ها در علوم مواد و انرژی با علوم مهندسی و تسخیر طبیعت نکات اشتراک و افتراقی داشته باشند.نکته مهم این است که در تحقیقات علوم طبیعی تجربه و حواس انسانی و آزمایش پذیری نقش مهمی ایفا می‌کنند که نباید حد و مرزهای آن را زیر پا گذاشت.